Библиотеки:

https://github.com/ftlabs/fastclick - убирает задержку 300мс в мобильных браузерах

http://greensock.com/jquery-gsap-plugin - jQuery плагин для увеличения производительности jQuery.animate() По тестам в 20 раз быстрее родного jQuery.animate().

Статьи:

http://blog.alexmaccaw.com/css-transitions

Сократить количество DOM элементов.

Минимизировать операции с DOM. Особенно на изменение. Вставлять сразу несколько элементов за раз.

Убрать таблицы или установить table-layout:fixed;

Для анимированных элементов использовать position: absolute или fixed;

Анимации с left, right, width, height и прочие вызывающие reflow заменить на аналоги -webkit-translate

Минимизировать reflow (процесс рекурсивного обхода ветви дерева DOM, вычисляющий геометрию элементов и их положение относительно родителя):

Reflow вызывают:

 - Изменение  css свойства: width, height, padding, margin, display, border-width,border, top, position, font-size, float, text-align, overflow-y, font-weight, overflow, left, font-family, line-height, vertical-align, right, clear, white-space, bottom, min-height.

- Для всех DOM элементов: clientHeight, clientLeft, clientTop, clientWidth, focus(), getBoundingClientRect(), getClientRects(), innerText, offsetHeight, offsetLeft, offsetParent, offsetTop, offsetWidth, outerText, scrollByLines(), scrollByPages(), scrollHeight, scrollIntoView(), scrollIntoViewIfNeeded(), scrollLeft, scrollTop, scrollWidth

- Для Frame, Image: height, width

- ДляRange: getBoundingClientRect(), getClientRects()

- ДляSVGLocatable: computeCTM(), getBBox()

- ДляSVGTextContent: getCharNumAtPosition(), getComputedTextLength(), getEndPositionOfChar(), getExtentOfChar(), getNumberOfChars(), getRotationOfChar(), getStartPositionOfChar(), getSubStringLength(), selectSubString()

- ДляSVGUse: instanceRoot

- Дляwindow: getComputedStyle(), scrollBy(), scrollTo(), scrollX, scrollY, webkitConvertPointFromNodeToPage(), webkitConvertPointFromPageToNode() - Изменение контента, в вставка дом элементов, даже набор текста инпуты.

 - Вычисление offsetWidth и offsetHeight (это тот же jQuery.offset(), position(), селектор ":hidden" )

Избегать изменение display (вызовет layout). Например для отображения окна можно использовать transform:

.hide{
   -webkit-transform: translateX(-99999px);
}
.show{
   -webkit-transform: translateX(0px);
}