Фамилия образована от прозвищ Яблоко, Яблочко. Такие "растительные" прозвища были не редки в старой Руси. В словаре Веселовского есть Яблочков Пятый Иванович, 1565 г., Мещоновск.
А однокоренная фамилия Яблочников уже от именования отца по роду деятельности. яблочник - то кто выращивает или торгует яблоками.