Относиться к "материнским" фамилиям и произошла от имени Аксинья - народный варинат имени Ксения - чужестранка, гостья (греч.).
Родственные фамилии Ксенин, Ксюшин, Оксанин, Оксашин (от Оксана - украинский вариант Ксении) (Э). . может быть образована и от имени Ксения через форму Ксенюшка с добавлением в начала А (как Ржаветинов - Аржаветинов), или же от имени Аксинья.